В указанном выше слове ударение следует ставить на слог с буквой Ы — двоякодЫшащих.
Дело в том, что один из современных видов двоякоды́шащих рыб, австралийский рогозуб... почти не отличается от ископаемого рогозуба, окаменелые останки которого были найдены в слоях возрастом более 100 млн.
— Илья Рухленко, Что ответить дарвинисту? Часть I, 2016
Её плавательный пузырь, как у всех современных двоякоды́шащих, исполнял роль лёгких.
— И. И. Любенко, Кровь на палубе, 2013
Они получили название двоякоды́шащих.
— Нил Шубин, Внутренняя рыба. История человеческого тела с древнейших времен до наших дней, 2008
Миклухо-Маклай в 1887 году писал, что эмбрионы у акул имеют парные выпячивания глотки, похожие на закладку парных лёгких у двоякоды́шащих рыб и наземных позвоночных.
— А. И. Белов, Тайная родословная человека. Загадка превращения людей в животных, 2012
У некоторых рыб, например двоякоды́шащих, у основания скелета плавников тоже имеется одна кость.
— Нил Шубин, Внутренняя рыба. История человеческого тела с древнейших времен до наших дней, 2008