В таком слове ударение должно быть поставлено на слог с буквой О — эубиОтики.
Выпускается в виде молочных спрессованных конфет, которые содержат в своём составе комплекс микроорганизмов (эубио́тики).
— В. С. Алексеев, Справочник БАДов, 2013
После курса лечения этими препаратами обязательно назначаются эубио́тики для восстановления нормальной микрофлоры кишечника.
— Коллектив авторов, Знакомьтесь, Ваш кишечник. Можно ли им управлять?, 2018
Это эубио́тики, т. е. бактериальные препараты, оказывающие регулирующее действие на микрофлору слизистых нашего организма.
— В. С. Алексеев, Справочник БАДов, 2013
Эубио́тики содержат живые бактерии.
— Е. Ю. Храмова, Лечение женских болезней традиционными и нетрадиционными способами, 2011
Бифидобактерии – микроорганизмы (эубио́тики), обитающие в нашем организме.
— В. С. Алексеев, Справочник БАДов, 2013