В данном слове ударение должно быть поставлено на слог с первой буквой И — энцефалопатИи.
Возможны признаки энцефалопати́и, отмечаются нистагм (непроизвольные быстрые ритмические движения глазных яблок), нарушения речи, дрожание.
— М. В. Дроздова, Заболевания крови, 2008
На биотрансформацию влияют характер питания, заболевания печени, половые особенности, возраст и ряд других факторов, причём при поражении печени усиливается токсическое действие многих лекарственных веществ на центральную нервную систему и резко возрастает частота развития энцефалопати́и.
— В. Н. Малеванная, Фармакология
Для предотвращения развития постгипоксической энцефалопати́и следует принимать меры, направленные на снижение интенсивности обменных процессов в мозге, а также препараты антигипоксического и антиоксидантного действия.
— Анестезиология и реаниматология: конспект лекций, 2007
Первой «угрозой века» стала уже совершенно забытая история с распространением среди людей вируса коровьей губчатой энцефалопати́и (или, проще, коровьего бешенства).
— Александр Соловьев, Апокалипсис: катастрофы прошлого, сценарии будущего, 2010
Заражение вирусом герпеса в это время менее опасно, но может стать причиной нарушения функций головного мозга, энцефалопати́и.
— Алевтина Корзунова, Золотой ус против герпеса, 2013