В таком слове ударение должно быть поставлено на слог с первой буквой А — штАммами.
Ещё бы, ведь его картины были выполнены не красками, а разноцветными шта́ммами бактерий, высеянных на картоне, покрытом питательным слоем.
— Светлана Зернес, Великие научные курьезы. 100 историй о смешных случаях в науке, 2011
Тот самый засекреченный военный объект, где шли работы с боевыми шта́ммами сибирской язвы.
— А. Л. Костин, Заговор Горбачева и Ельцина. Кто стоял за хозяевами Кремля?, 2010
А если их можно выделить, значит, на них возможно произвести атаку боевыми шта́ммами.
— С. В. Самаров, Мертвая армия, 2014
Мочевой пузырь (орган вообще-то весьма стерильный) оказался населён многочисленными и резистивными к антибиотикам шта́ммами бактерий.
— Робин Чаткан, Жизнь кишечника. Борьба за бактерии, 2015
Йогурт — молочный продукт, полученный при заквашивании молока специальными шта́ммами молочнокислых стрептококков и болгарской палочки.
— Н. М. Пчелинцева, Кулинария при язве желудка