В таком слове ударение должно быть поставлено на слог с последней буквой О — чистотОю.
Одевшись с тою тщательностью и чистото́ю, к которой мы привыкаем, долго живши за границей, и от которой скоро отвыкаем в провинции, он, твердый в намерении заняться политической экономией, лег на то же место и развернул какую-то английскую брошюру об Адаме Смите.
— Александр Герцен, Кто виноват?
Он очень гордится чистото́ю своей белой шкурки, и все время, когда не спит и не предается разбою, он беспрерывно чистится.
— Александр Куприн, Париж интимный
Смешно и нелепо было бы также рекомендовать людям, занятым чистото́ю и здоровьем громадного города, чтобы они следили за гигиеническим поведением и за чистоплотностью каждой бойкой и резвой парижской девочки семи лет.
— Александр Куприн, Париж интимный
Чистота белья, чистота комнат, чистота их очертаний, сливаясь с чистото́ю ночи, снега, звезд и месяца в одну равнозначительную, сквозь сердце доктора пропущенную волну, заставляла его ликовать и плакать от чувства торжествующей чистоты существования.
— Борис Пастернак, Доктор Живаго
Весь секрет и волшебство ее красоты заключались именно в этих мелких, бесконечно изящных движениях, в улыбке, в игре лица, в быстрых взглядах на нас, в сочетании тонкой грации этих движений с молодостью, свежестью, с чистото́ю души, звучавшею в смехе и в голосе, и с тою слабостью, которую мы так любим в детях, в птицах, в молодых оленях, в молодых деревьях.
— Антон Чехов, О том, о сём…