В таком слове ударение должно быть поставлено на слог с буквой О — халцедОны.
Сердолики, халцедо́ны, кремни объединены своими не только физико-химическими свойствами, но благотворнейшим оздоравливающим влиянием на человека.
— Елена Лома, Лечебная магия, 2008
Сердолики, халцедо́ны, кремни объединены своими не только физико-химическими свойствами, но благотворнейшим оздоравливающим влиянием на человека, что известно с древности.
— И. А. Мудрова, Книга примет и суеверий, 2011
Но халцедо́ны образуются в известняках, а все земные известняки имеют биогенное происхождение.
— А. Н. Громов, Удивительная Солнечная система, 2012
Серый мрамор, малахит в причудливых прожилках, пёстрые агаты, яшмы, халцедо́ны, сердолики, выброшенные на берег штормовой волной.
— Наталья Солнцева, Кольцо с коралловой эмалью
У меня есть хризолиты и бериллы, хризопразы и рубины, сардониксы и гиацинты, и халцедо́ны, я отдам тебе их всё и к ним прибавлю ещё много других вещей.
— Оскар Уайльд, Саломея. Портрет Дориана Грея (сборник), 1891,1893