В таком слове ударения падают на слог с первой буквой И и на слог с последней буквой И — фИлогенетИческом.
Вот так примерно выглядит моя подгруппа на фи́логенети́ческом дереве гаплогруппы I1.
— Александр Пересвет, Русские до истории, 2017
Гарднера, рассмотрела и выделила в фи́логенети́ческом аспекте появление девяти видов человеческих способностей и отмечает их роль в музыкальном и других талантах.
— Коллектив авторов, Психология одаренности и творчества, 2017
Врождённое спонтанное поведение находится, однако, «в открытом неподчинении обеим этим догмам… оно не только абсолютно неизменно у индивидуума, но даже в фи́логенети́ческом ряду имеет довольно консервативный и слабо изменяемый характер» [43: 247].
— Варвара Дьяконова, Пострефлекторная нейробиология поведения, 2019
При этом повреждение более древних в фи́логенети́ческом плане тканей и структур переносится организмом легче, чем сформировавшихся позднее, что обусловлено различными возможностями компенсации нарушенных функций на фоне регенерации и мощными механизмами саногенеза.
— Коллектив авторов, Оперативные доступы в нейрохирургии. Том 1. Голова, 2014