В таком слове ударение должно быть поставлено на слог с последней буквой Е — университЕты.
Тех, кто родился и вырос в Нью-Хэмпшире, университет родного штата — пусть он обеспечивал вполне солидное образование — не вдохновлял; ученики Грейвсендской академии с их аристократическими замашками, признающие только университе́ты Лиги Плюща, называли Нью-Хэмпширский университет безнадежной «сельской школой».
— Джон Ирвинг, Молитва об Оуэне Мини
Надо заняться книгами и обеспечить ими университе́ты всего мира.
— Умберто Эко, Имя розы
Я мог бы сослаться также на польских студентов, посылаемых ежегодно в русские университе́ты для удаления от родных влияний; пусть они расскажут, как принимали их русские товарищи.
— Александр Герцен, Кто виноват?
Но какая смешная мысль: вообразить только, что все эти симпатичные девицы нарочно и усиленно начнут рождать детей только что услышат, что тех отдадут в университе́ты.
— Федор Достоевский, Дневник писателя
При этом история городов раскрывалась часто через материальные памятники культуры – музеи, дворцы, соборы и библиотеки, университе́ты; история стран оказывалась запечатленной в литературе, науке, искусстве.
— Николай Карамзин, Бедная Лиза