В таком слове ударения ставят на слог с первой буквой О и на слог с последней буквой О — стОмиллиОнную.
Точка типографского шрифта весит примерно одну сто́миллио́нную грамма.
— Серебряный Дождь, Кстати: интересные факты из нашей жизни, 2019
Быстро набрав сто́миллио́нную аудиторию, прекрасная жена и заботливая мама тройняшек, она неистово пропагандировала здоровый образ жизни и модный нынче фейсбилдинг.
— Алла Добрая, Смерть в Голограм, 2019
Богаты настолько, что в состоянии содержать сто́миллио́нную профессиональную армию, отлично вооружённую и экипированную.
— Юрий Львович Киселев, Лестница Бога. Обретение магии. Часть 3. Новый мир, 2017
Соответственно, между моим телом и стулом остаётся микроскопический зазор в одну сто́миллио́нную долю сантиметра.
— Андрей Кананин, Нереальная реальность. Вся трилогия в одной книге
Но отдельные люди, каждый из которых несёт лишь ничтожную, сто́миллио́нную долю общей ответственности, отдельные люди страдают всё-таки безвинно, и никакими ссылками на летящие при рубке леса «щепки» оправдать этого нельзя.
— Георгий Адамович, Собрание сочинений в 18 т. Том 11. Литература и жизнь («Русская мысль»: 1955–1972)