В данном слове ударение должно быть поставлено на слог с первой буквой И — регИстрами.
Диковато сидеть там одному наверху со всеми этими педалями, клавишами, реги́страми.
— Джеймс Джойс, Улисс
Заведенная еще вольноотпущенниками Клавдия огромная административная машина со всевозможными списками, реги́страми, отчетностью и строгой нумерацией, действовала без перебоев.
— Антонин Ладинский, XV легион. Последний путь Владимира Мономаха
Задолго до Баха, и в то время, когда еще не строили больших монументальных органов, но лишь очень скромные эмбриональные прообразы будущего чудища, когда ведущим инструментом была еще цитра, аккомпанирующая голосу, Алигьери построил в словесном пространстве бесконечно могучий орган и уже наслаждался всеми его мыслимыми реги́страми и раздувал мехи и ревел и ворковал во все трубы.
— Осип Мандельштам, Век мой, зверь мой
Сии-то подразделения называются реги́страми.} в органе.
— Владимир Одоевский, Русские ночи