В таком слове ударение должно быть поставлено на слог с первой буквой Я — подчинЯется.
Когда женщина подчиня́ется какому-то капризу или прихоти, то по свойственному ей легкомыслию или какому-нибудь другому недостатку она упускает это из вида.
— Томас Гарди, Вдали от обезумевшей толпы
Это не значит, что все «случайно», поскольку бытие подчиня́ется непреложным законам природы.
— Юстейн Гордер, Мир Софии
Рядом с ней грустно стоит Ольга из «Трех сестер»: она тоже много любит и безропотно подчиня́ется капризам развратной и пошлой жены своего лентяя-брата, на ее глазах ломается жизнь ее сестер, а она плачет и никому ничем не может помочь, и ни одного живого, сильного слова протеста против пошлости нет в ее груди.
— Максим Горький, На дне. Избранное
А гипнотизм, когда один субъект, против желания, подчиня́ется приказаниям другого?
— Александр Куприн, Олеся
Всем, кто согласен с нами, кто подчиня́ется нашей воле, мы отведем сельскую усадьбу и обеспечим жизнь и комфорт.
— Алексей Толстой, Гиперболоид инженера Гарина. Аэлита. Похождения Невзорова, или Ибикус