В данном слове ударение должно быть поставлено на слог с последней буквой Е — подземЕльям.
— Представляю, как Грюм превратил Снегга в рогатую жабу и заставил скакать по всем его подземе́льям...
— Джоанн Роулинг, Гарри Поттер и кубок огня
Он отчетливо помнил только три первых дня обороны, а потом дни и ночи сливались в единую цепь вылазок и бомбежек, атак, обстрелов, блужданий по подземе́льям, коротких схваток с врагом и коротких, похожих на обмороки, минут забытья.
— Борис Васильев, Завтра была война
– Положение христиан было тогда тоже очень печальное, они четыре столетия прятались по подземе́льям, успех казался невозможным, жертвы были перед глазами.
— Александр Герцен, Кто виноват?
Белый, хрустальный, сияющий поезд линии Норд-Зюйд – подземной дороги – мчался с тихим грохотом по темным подземе́льям под Парижем.
— Алексей Толстой, Гиперболоид инженера Гарина. Аэлита. Похождения Невзорова, или Ибикус