В данном слове ударение следует ставить на слог с последней буквой О — перекомпонОвки.
Из-за перекомпоно́вки машины и стремления не перетяжелить её пришлось отказаться от переднего топливного бака.
— Николай Якубович, Неизвестный Яковлев. «Железный» авиаконструктор, 2012
Разработан специально для космонавтов-первопроходцев (существует возможность иной перекомпоно́вки салона для мормонов, ортодоксов, буддистов и проч.).
— Дмитрий Емец, Вселенский неудачник, 2002
Она более отвечает гражданскому обществу с его модульными возможностями перекомпоно́вки своих структурных образований в соответствии с конъюнктурой рынка и рыночных отношений.
— Коллектив авторов, Гражданское общество. Истоки и современность, 2006
В других пьесах сырьём для перекомпоно́вки служили вымысел, приключения, автобиографический опыт; здесь же materia prima является исторической, а центральной темой служит извечная нравственная проблема.
— Владимир Набоков, Изобретение Вальса (сборник)
Он никогда не терял голову, когда иногда приходилось с кем-нибудь выпивать, но на этот раз тяжело встретил перспективу быть уволенным новым хозяином компании, который начал с традиционных сокращений, слияний и перекомпоно́вки отделов.
— Андрей Мошанов, На Темзе всегда клюёт