В таком слове ударения следует ставить на слог с буквой А и на слог с третьей буквой И — пАтофизиологИческими.
Но это не так уже в силу того, что облигатная элиминация старых особей из популяции обеспечивается разными па́тофизиологи́ческими механизмами совершенно разных болезней.
— Валерий Новоселов, Ключ к долголетию. Научные знания о старении и полезные советы о том, как использовать свой возраст на maximum, 2019
Ведущее значение иммунологических нарушений заключено в системной воспалительной реакции (СВР) и обусловлено па́тофизиологи́ческими изменениями в организме.
— Никита Александрович Кривушкин, Пособие по изучению иммунного ответа. Патофизиология TLR и её влияние на механизмы развития патогенеза заболеваний иммунной системы
Что касается классов заболеваний (I, II, III и т. д.), то они объединяют те нозологические формы, возникновение которых обусловлено общими па́тофизиологи́ческими и патолого-анатомическими механизмами (например, воспалением, травмой, пороком развития и др.).
— В. И. Бабияк, Оториноларингология: Руководство. Том 2, 2009
Так, не переставая следить за их органической природой (за их сложными, изменчивыми па́тофизиологи́ческими и биологическими нарушениями), я поставил себе главной задачей изучение их идентичности – борьбы за поддержание этой идентичности – для того, чтобы наблюдать её, оказать им посильную помощь в её сохранении и, наконец, чтобы описать её.
— Оливер Сакс, Пробуждения