В данном слове ударение следует ставить на слог с последней буквой Е — патогенЕза.
Одно из них обосновывало ведущую роль почки, другое – считало начальным и главным звеном патогене́за изменение геометрии просвета периферических артерий и повышение периферического сосудистого сопротивления.
— Марк Жолондз, Новый взгляд на гипертонию: причины и лечение. 4 сенсации Жолондза, 2010
Назначение лекарственных средств для лечения зубов и полости рта в целом без учёта этиологии и патогене́за болезни может принести больше вреда, чем пользы.
— В. В. Фролов, Стоматология собак
В этой связи у сторонников современной психиатрии появился аргумент, подтверждающий биологическую основу патогене́за депрессивных и тревожных состояний.
— Януш Рыбаковский, Лики маниакально-депрессивного расстройства, 2008
Со стороны аллергического иммуногенного механизма патогене́за частота развития нефрита в осенне-зимние месяцы может рассматриваться как результат рефлекторного нарушения кровоснабжения и трофики почек вследствие охлаждения, играющего роль разрешающего фактора в ранее сенсибилизированном организме.
— Елена Белянская, Лечебное питание при болезнях почек, 2013
Такова общая конструкция патогене́за первичной гипертензии беременных, составляющая основу мембранной концепции.
— Валерий Абрамченко, Фармакотерапия гестоза, 2005