В упомянутом выше слове ударение следует ставить на слог с последней буквой А — наплывАли.
На западе, над темной линией горизонта, наплыва́ли медно-красные облака, подобно песчаным берегам и мысам, окаймлявшие прозрачный зеленоватый простор небес.
— Томас Гарди, Вдали от обезумевшей толпы
Короткие и черные клочья тумана снизу наплыва́ли на холмы и вдруг отрывались от них, словно клубы дыма.
— Виктор Гюго, Отверженные
В небе светила яркая луна, но на неё всё время наплыва́ли облака и погружали землю во мрак.
— Джоан Ролинг, Гарри Поттер и философский камень
Стены замка пронеслись мимо, замковый ров и земля наплыва́ли на Варта.
— Теренс Уайт, Меч в камне
Когда эшелон перевалил за Урал, перед глазами возникали и в беспорядке наплыва́ли многоярусные домины с глазастыми стенами, кривые улицы, зубчатая стена Кремля, кружилась колокольня Ивана Великого и та девица – белокожее создание, и Филя потешался над ней: «Экая желторотая фитюлька!
— Алексей Черкасов, Хмель