В данном слове ударение должно быть поставлено на слог с первой буквой Е — мицЕлием.
Помимо плодового тела, у каждого гриба высшей группы есть вегетативное тело, которое микологи называют мице́лием, а большинство грибников — грибницей.
— Т. В. Шнуровозова, Грибы. Выращиваем на своем участке, 2012
Спустя 2 — 3 месяца после заражения обрубков они обрастают мице́лием, при этом срастаются так плотно, что за их верхние части можно поднять всю колонну.
— Г. Ю. Лазарева, Выращивание грибов, 2013
После сбора шампиньонов парниковую землю отбрасывают в сторону, а оставшийся навоз с мице́лием укладывают в ящики и переносят в погреб для дальнейшего использования.
— Г. Ю. Лазарева, Выращивание грибов, 2013
На 1 м2 компоста с заложенным туда мице́лием требуется 30 кг покровной смеси.
— Г. Ю. Лазарева, Выращивание грибов, 2013
Иногда гифы объединяются и образуют массу, которую именуют мице́лием.
— Г. Ф. Распопов, Как создать эко огород. Советы врача и садовода с 40-летним стажем!