В упомянутом выше слове ударения падают на слог с первой буквой И и на слог со второй буквой И — мИкроорганИзмами.
Кроме того, в носовой полости вдыхаемый воздух увлажняется, а носовая слизь благодаря местному иммунитету борется с вредными ми́крооргани́змами и вирусами.
— Наталья Ольшевская, 365 золотых упражнений по дыхательной гимнастике, 2009
Образование гнойников при фурункулёзе вызывается ми́крооргани́змами (стрептококками, стафилококками).
— Алевтина Корзунова, Подорожник, одуванчик, лопух, 2013
Состав нормальной микрофлоры в организме человека образован аэробными и анаэробными ми́крооргани́змами.
— Н. В. Гаврилова, Инфекционные заболевания: конспект лекций
Поэтому, интересуясь жизнью микроорганизмов почвы, невольно провожу параллели с ми́крооргани́змами в кишечнике человека.
— Г. Ф. Распопов, Как создать эко огород. Советы врача и садовода с 40-летним стажем!
Все эти вещества перерабатываются в компост особыми ми́крооргани́змами, которые нуждаются в определённых химических элементах.
— Анна Васильева, Огород и сад. Планируем с умом для сверхурожая, 2016