В данном слове ударения падают на слог с первой буквой Е и на слог с буквой Ы — мЕжвидовЫе.
Особенно нестабильны в этом смысле сложные ме́жвидовы́е гибриды.
— Н. И. Курдюмов, Виноград и другие ягоды вашего сада, 2013
Иногда даже встречаются ме́жвидовы́е гибриды, в настоящее время выведены садовые сорта.
— Алевтина Корзунова, Морозник, 2013
Вы уж не обижайтесь, но объяснять всякие ме́жвидовы́е премудрости очень тяжело.
— А. Ю. Патрикеев, Мир за дверью
Ме́жвидовы́е браки рыжих и чёрных представителей тараканьего племени привели к появлению невиданных доселе тварей леопардовой расцветки, не чувствительных вообще ни к чему, кроме ударно-механического воздействия, и то усилие требовалось не маленькое.
— А. Н. Громов, Властелин пустоты, 1997
Ме́жвидовы́е гибриды: племкоты (плоды, полученные скрещиванием абрикоса и сливы) и плюоты (плоды, полученные скрещиванием сливы и абрикоса).
— Коллектив авторов, Товароведение однородных групп продовольственных товаров, 2014