В таком слове ударение следует ставить на слог с последней буквой А — магистрАльным.
Необходима выработка и неотложное введение жёстко регулируемого парковочного режима применительно к каждому типичному элементу улично-дорожной сети – магистра́льным улицам, площадям, бульварам, местным проездам.
— Вукан Р. Вучик, Транспорт в городах, удобных для жизни, 2011
Австралийцы помешаны на фитнесе, поэтому велосипедистам позволяется двигаться по магистра́льным трассам.
— Джон Маклин, Как далеко ты сможешь пройти?, 2016
Для них этот путь является магистра́льным и, нередко, предоставляет возможность личностного роста и успешной социализации.
— Мария Вальдес Одриосола, Интуитивное рисование: Развитие творческих способностей средствами арттерапии, 2009
Развитие мира носит линейно-поступательный, однонаправленный и безальтернативный характер; имеющие место отдельные случайные альтернативы поглощаются магистра́льным течением событий.
— Ч. С. Кирвель, Социальная философия, 2013