В таком слове ударение следует ставить на слог с последней буквой О — колпакОм.
Тяжеленная торба торчала у него над головой, покрытой старым фетровым колпако́м, который Сэм почему–то называл шляпой.
— Джон Толкин, Властелин колец
А когда он в последний раз полил и собрался накрыть колпако́м чудесный цветок, ему даже захотелось плакать.
— Антуан Экзюпери, Маленький Принц
Юрисконсульт поразил холодностью своего вида, замасленностью своего халата, представлявшего совершенную противуположность хорошим мебелям красного дерева, золотым часам под стеклянным колпако́м, люстре, сквозившей сквозь кисейный чехол, ее сохранявший, и вообще всему, что было вокруг и носило на себе яркую печать блистательного европейского просвещения.
— Николай Гоголь, Мертвые души
Все жили точно под стеклянным колпако́м, о каждом было известно всё, чего не нужно знать о человеке, и каждый знал обо всех остальных всё, что хотел знать.
— Максим Горький, На дне. Избранное
Сам на тебя смотрю,- ты за столом, за колпако́м зеленым, пишешь.
— Юрий Олеша, Сборник "Три толстяка"