В данном слове ударение следует ставить на слог с последней буквой И — дифференцИруются.
Составы преступлений дифференци́руются по самым различным основаниям.
— Коллектив авторов, Полный курс уголовного права. Том II. Преступления против личности, 2008
Специфические пошлины дифференци́руются по группам оборудования, к которым относятся запасные части — механические детали, электрооборудование, гидравлическая аппаратура; по материалам, из которых они изготовлены — чёрные или цветные металлы, резина или пластмасса; по назначению деталей или узлов.
— В. В. Волгин, Магазин запасных частей. Стандарты управления: Практическое пособие, 2013
Страх перед неизведанным знаком каждому, но для малышей трудность преодоления этого страха связана с тем, что в детстве страхи плохо дифференци́руются и чрезмерно генерализуются, то есть переносятся на самые разные ситуации, в принципе не угрожающие ребёнку.
— О. И. Маховская, Слышать, понимать и дружить со своим ребенком. 7 правил успешной мамы, 2015
Позднее всего дифференци́руются колбочки и палочки, центральная ямка сетчатки начинает развиваться с 6-го месяца, завершая своё созревание лишь ряд месяцев спустя после рождения.
— Л. В. Шильников, Энциклопедия клинических глазных болезней
На втором уровне организационного структурирования государственного управления — административном — властно-управленческие функции как бы дифференци́руются на различные организационно-управленческие компоненты: планирование, организация, регулирование, исполнение, информирование, бюджетирование, координация, контроль.
— Коллектив авторов, Беларусь на пути в будущее. Социологическое измерение, 2015