В таком слове ударение должно быть поставлено на слог с первой буквой У — гомУнкулусы.
Она подозревала, что гому́нкулусы появились во дворце не просто так, что очень скоро должно что-то случиться.
— Евгений Гаглоев, Аграфена и тайна Королевского госпиталя, 2018
– Просто больше живых людей гому́нкулусы ненавидят только других искусственно созданных тварей!
— Анна Велес, Сердце Отроч монастыря, 2020
Обладая большой массой тела, гому́нкулусы становились лёгкой мишенью, к тому же и живучесть у них была ненамного выше, чем у обычных людей, умирали они быстро, получив разрывную пулю в сердце или в голову, а в другие места десантники и не стреляли.
— Владимир Лосев, Звезды во мраке, 2008
Конечно, может они средневековые гому́нкулусы, из помойного ведра самостийно зародились?
— Олег Ока, Пилигрим
Ведь эти гому́нкулусы встречаются чаще других форм, видимо, это инерция обывательского сознания.
— Эдуард Веркин, Место Снов, 2006