В таком слове ударение должно быть поставлено на слог с первой буквой У — гомУнкулом.
Странные детские мордашки и сходство с гому́нкулом объясняют популярность аксолотлей среди аквариумистов.
— Каспар Хендерсон, Книга о самых невообразимых животных. Бестиарий XXI века, 2012
Но сам факт того, что этот парень умел оперировать подобными плетениями уже полностью отрицал факт того, что он является гому́нкулом.
— Хайдарали Усманов, Гомункул. Каникулы, 2019
Представив себе, что он сейчас будет общаться с каким-нибудь гому́нкулом или големом, пытаясь ему объяснить то, что ему нужно найти в этом здании, парень едва сдержал свой нервный смех.
— Хайдарали Усманов, Гомункул. Каникулы, 2019
Раньше все они были людьми. Именно людьми, а не василисками! Это важно. Только человек может стать гому́нкулом, пока… не умрёт.
— Илья Сергеевич Ермаков, «Сон Феникса»: Скрижаль Смерти, 2019
Воскрешённые гому́нкулом кролики издыхали – вот что выбило профессора из колеи!
— Алексей Жарков, Избранные. Боди-хоррор