В данном слове ударение должно быть поставлено на слог с последней буквой И — гильотИну.
— Вы, верно, спрашиваете про Гильоти́ну?
— Чарльз Диккенс, Повесть о двух городах
…передвижную машину с мешком и ножом — то есть гильоти́ну.
— Чарльз Диккенс, Повесть о двух городах
Первый раз в жизни Франц видел гильоти́ну; мы говорим гильоти́ну, потому что римская mandaia очень похожа на французское орудие смерти.
— Александр Дюма, Граф Монте-Кристо
Пересчитайте, сколько невинных голов легло под гильоти́ну.
— Кондратий Биркин, Временщики и фаворитки
Победивши, они думали: вот теперь-то… но теперь-то их повели на гильоти́ну, и это было самое лучшее, что́ могло с ними случиться: они умерли с полной верой, их унесла бурная волна, середи битвы, труда, опьяненья, они были уверены, что, когда возвратится тишина, их идеал осуществится без них, но осуществится.
— Александр Герцен, Кто виноват?