В данном слове ударение следует ставить на слог с последней буквой О — бактериолОгию.
Помню, когда я изучал бактериоло́гию, у нас был очень хороший профессор: он старался рассказать нам и о бактериофагах, и о вирусах — всё для того, чтобы у нас составилось лучшее представление о категории в целом.
— Ханс Ульрих Обрист, Краткая история кураторства, 2012
Медицинская микробиология занимается изучением патогенных для человека микроорганизмов и в зависимости от их природы делится на бактериоло́гию, вирусологию, микологию и протозоологию.
— Аурика Луковкина, Полный курс за 3 дня. Микробиология, 2009
Он серьёзно изучал медицину, анатомию, физиологию, бактериоло́гию, психологию, психические заболевания, философию, различные религии, историю наук.
— М. Ф. Гогулан, Система Гогулан. Иллюстрированный курс. Упражнения и советы, 2014
Серьёзно изучив медицину, анатомию, физиологию, бактериоло́гию, психологию, философию, практику различных религий, я могу сказать, что для здоровья всего организма необходимо привести в порядок в первую очередь физическое состояние, затем химические и бактериологические показатели, а затем и умственное состояние.
— Кацудзо Ниши, Алхимия здоровья: 6 «золотых» правил