Обычно алле́ли обозначаются буквами латинского или греческого алфавита, а если их много, то с верхним индексом.
— Н. А. Курчанов, Поведение: эволюционный подход, 2011
Если при минимальной скорости мутаций в DYS472 сохранились неизменными 3461 предковые алле́ли в гаплотипах 3466 потомков (константа скорости мутации 0. 000008 на условное поколение), и в DYS617 сохранились неизменными 2921 предковые алле́ли в гаплотипах 3466 потомков (константа скорости мутации на в 63 раза выше, 0. 0005 на условное поколение), то в случае самого «быстрого» маркёра сохранились всего 1058 предковые (базовые) алле́ли, и число мутаций равно 3594 вместо 5 в DYS472, то есть в 700 с лишним раз больше.
— А. А. Клёсов, Кому мешает ДНК-генеалогия? Ложь, инсинуации, и русофобия в современной российской науке, 2016
Знаки X указывают на пропущенные алле́ли в ископаемых гаплотипах.
— А. А. Клёсов, Кому мешает ДНК-генеалогия? Ложь, инсинуации, и русофобия в современной российской науке, 2016
Как мы покажем ниже, гаплотипы, а именно числа в них, называемые алле́ли, напрямую связаны с хронологией древних миграций людей, переходами людей на новые места, событиями прошлого — войнами, климатическими катаклизмами, эпидемиями, в общем, со всем тем, что так или иначе влияло на численность популяций человека в определённые времена и на определённых территориях.
— А. А. Клёсов, Кому мешает ДНК-генеалогия? Ложь, инсинуации, и русофобия в современной российской науке, 2016
Только две алле́ли (числа в гаплотипах выше) различались на один шаг, 10 и 11 в четвёртом положении (DYS391), и 19 и 20 ближе к концу гаплотипа (DYS 448).
— А. А. Клёсов, Кому мешает ДНК-генеалогия? Ложь, инсинуации, и русофобия в современной российской науке, 2016