В данном слове допускается ставить ударение либо на слог с буквой Я — штабелЯми, либо на слог с буквой А — штАбелями.
За спиной возницы, забившись в узкую щель между штабеля́ми досок, спало какое-то существо.
— Терри Пратчетт, Пятый элефант
Трупы лежат шта́белями, в конце Мойки целые переулки и улицы из штабелей трупов.
— Ольга Берггольц, Ленинградский дневник
Могучее воображение заполнило его грохотом боевых машин, воплями и стонами сотен тысяч людей, штабеля́ми трупов на изрытой каменистой почве.
— Иван Ефремов, Час Быка
Губернатора на балконе сменил начальник полиции: он обещал толпе, что не пройдет и пяти-шести часов, как все увидят войска противника, сложенные повзводно шта́белями – вот на этой самой площади, как на складе.
— Сигизмунд Кржижановский, Тринадцатая категория рассудка
Не доходя шагов ста до трамвая, он услышал возню и писк между шта́белями торцов.
— Алексей Толстой, Гиперболоид инженера Гарина. Аэлита. Похождения Невзорова, или Ибикус