В таком слове ударение должно быть поставлено на слог со второй буквой О — фитофтОрой.
Да, я с вами полностью согласен: существующая ныне система управления колониями прогнила, как поражённая фитофто́рой картофелина.
— Олег Волков, Война на Свалке. Тетралогия «Свалка человеческих душ» – 2
Не любят томаты загущённые посадки и плохое проветривание – это вызывает раннее заболевание фитофто́рой и сильное вытягивание растений.
— Галина Кизима, Энциклопедия начинающего огородника и садовода в картинках, 2019
Дважды в месяц опрыскивайте рассаду томатов очень слабым раствором медного купороса вместо обычно рекомендуемого раствора марганцевокислого калия – томат накопит медь в тканях и это убережёт его от раннего заболевания фитофто́рой.
— Галина Кизима, Крепкая рассада – богатый урожай. Все секреты опытного огородника, 2016
Эта операция способствует лучшему созреванию клубней и предохраняет их от поражения фитофто́рой при уборке.
— Группа авторов, Все о вентиляции и теплозащите, 2012
Томаты хорошо растут после капусты, огурцов, кабачков, тыквы, бобовых, но не сажайте их там, где рос картофель, так как и томаты и картофель часто поражаются фитофто́рой, которая передаётся не только через семена, но и через почву.
— Евгения Валягина-Малютина, Сад и огород круглый год, 2012