В таком слове ударение должно быть поставлено на слог с первой буквой Е — саддукЕев.
Они сообщили о намерении своём первосвященникам, которые, принадлежа к секте саддуке́ев, были очень ожесточены против святого апостола.
— А. Н. Бахметева, Полная история Христианской Церкви, 2010
Он всенародно обличал в храме саддуке́ев и фарисеев.
— Александр Холин, Ахашверош, или Приключения Вечного Жида, 2014
Всё это грозило умалить значение храма и совершаемых в нём богослужений, что и заставило прийти к нему даже саддуке́ев и священников, прежде происходившим в самой стране, за пределами её столицы, нисколько не интересовавшихся.
— Фридрих Цюндель, Иисус. Картины жизни, 1884
Позиция саддуке́ев была безвозвратно разрушена.
— Митрополит Владимир (Иким), Вечное сокровище: Свет Преображения, 2014
В храме на сей раз, прокатился явный ропот саддуке́ев и фарисеев, не соглашающихся превратиться так вот запросто в поклоняющихся пророку и верных слуг его.
— Александр Холин, Юность Моисея, 2014