В упомянутом выше слове ударение падает на слог с первой буквой И — протоколИрование.
Он содержит полный набор механизмов контекстного контроля доступа пользователей, протоколи́рование событий и теневое копирование данных.
— PC Magazine/RE, Журнал PC Magazine/RE №5/2011
Среди многообразных форм фиксации, установленных уголовно-процессуальным законом, основное место занимает письменная форма — протоколи́рование.
— Коллектив авторов, Настольная книга следователя, 2008
При фиксации применяют фотографирование, киносъёмку, видеозапись, измерение, описание, мыслительное моделирование, звукозапись, протоколи́рование, составление схем и масштабных планов, чертежей, рисунков, изъятие предметов в натуре и их консервацию, изготовление материальных моделей (копирование, получение слепков и оттисков).
— Н. В. Кормушкина, Конспект лекций по криминалистике, 2009
Ведёт протоколи́рование договоренностей и событий, заключений договоров и позволяет проводить все эти операции локально или на расстоянии через планетарную сеть.
— К. Н. Муравьёв, Неучтённый, 2012
Включить активацию и протоколи́рование (каталогизацию) неопознанных опций при обращении к ним?
— К. Н. Муравьёв, Неучтённый, 2012