В таком слове ударение должно быть поставлено на слог с первой буквой И — подгнИвшие.
Напуганные животные прорвались через ограду на верхнее пастбище; пес погнал их наперерез вверх по склону и пригнал к обрыву, где они всем гуртом сбились у мостков; подгни́вшие доски не выдержали, и все стадо рухнуло в яму.
— Томас Гарди, Вдали от обезумевшей толпы
Почти все красивые, крепкие, но есть и подгни́вшие.
— Томас Гарди, Тэсс из рода д'Эрбервиллей
И тем самым засушить все деревце, а потом и вывернуть наружу подгни́вшие корни...
— Анатолий Иванов, Тени исчезают в полдень
Прожил он в хуторе недолго: поправил подгни́вшие сохи и стропила сараев, вспахал две десятины земли, потом как-то целый день пестовал сынишку, сажал его на свою вросшую в плечи, провонявшую солдатчиной шею, бегал по горнице, смеялся, а в углах светлых, обычно злобноватых глаз заметила жена копившиеся слезы, побелела: «Либо уезжаешь, Андрюша?» — «Завтра.
— Михаил Шолохов, Поднятая целина
Он смутно догадывался, что в смерти Хопрова есть причинная связь с коллективизацией, с новым, бурно ломившимся в подгни́вшие стены раздробленного хозяйства.
— Михаил Шолохов, Поднятая целина