В данном слове ударения ставят на слог с буквой У и на слог с первой буквой Е — наУчно-исслЕдовательский.
Замминистра, занятый недоделками, приемкой законченных объектов, вдруг обнаружил, что Картос самовластно, но исподволь превращает центр в нау́чно-иссле́довательский комплекс, разворачивая там “опережающую” работу.
— Даниил Гранин, Зубр. Бегство в Россию
Одно время, длилось это года два, Марат перестал работать на прибрежном бульваре, а устроился в научно–исследовательский институт, где получил фотолабораторию и даже был засекречен.
— Фазиль Искандер, Сандро из Чегема
– А вы ещё не знаете? – покойно удивился он. – Имеется такое постановление нашего министерства и вот, – он кивнул, – комитета, что важный номерной нау́чно-иссле́довательский институт, запланированный открыть в нашем городе, будет размещён в тех зданиях, которые первоначально предполагалось отдать вашему техникуму.
— Александр Солженицын, Рассказы
– А про этот институт нау́чно-иссле́довательский ты слышал что-нибудь, Иван Капитонович?
— Александр Солженицын, Рассказы