В таком слове ударение должно быть поставлено на слог со второй буквой О — мукомОльная.
Дело в том, что отечественная мукомо́льная промышленность настолько отбеливает и очищает от всяких (в том числе и полезных) примесей муку, что в ней не остаётся ничего хорошего, она напрочь лишается питательных качеств, а посему, кроме лишних объёмов, ничего не даёт организму.
— Валентина Травинка, Разыщи в себе радость, 2016
Развивалась переработка сельскохозяйственной продукции, мукомо́льная и винокуренная промышленность.
— Сборник статей, Пути России. Новый старый порядок – вечное возвращение? Сборник статей. Том XХI, 2016
Мукомо́льная промышленность — это крупнейшая отрасль пищевой промышленности, которая вырабатывает муку для розничной торговли, а также для хлебопекарной, кондитерской и других отраслей.
— Коллектив авторов, Товароведение однородных групп продовольственных товаров, 2014
Мукомо́льная промышленность в процессе конкуренции начала изобретать все новые, всё более совершенные методы получения всё более и более белой муки.
— М. Ф. Гогулан, Как ускорить выздоровление. Личный опыт Майи Гогулан, 2012
Под нами, улицей ниже, находилась мукомо́льная мельница.
— Георгий Задорожников, Мемуары старого мальчика (Севастополь 1941 – 1945), 2013