В указанном выше слове ударение следует ставить на слог с последней буквой Е — многотысячелЕтняя.
Сразу вся многотысячеле́тняя история славян, начиная с истоков славянской цивилизации и культуры, оказывается за бортом отечественной истории.
— В. А. Рыбников, Сыны Перуна, 2012
Имеется многотысячеле́тняя история и у славянских народов.
— И. Е. Кольцов, Русская Атлантида. К истории древних цивилизаций и народов, 2012
Многотысячеле́тняя воспроизводимость гендерной семантики цветовых канонов по существу являлась объективацией субъективных проявлений интеллекта.
— Н. В. Серов, Символика цвета, 2015
До сих пор в регионе нет ни одного специализированного археологического музея, а его многотысячеле́тняя история представлена лишь в нескольких небольших залах краеведческих музеев.
— Маргарита Изотова, Инновации в социокультурном сервисе и туризме
С вас уже довольно, ваша многотысячеле́тняя история переполнена войнами и насилием, и так больше продолжаться не может.
— Тамара Шмидт, Крайон. Лунный календарь на 2015 год. Что и когда надо делать, чтобы жить счастливо, 2014