В данном слове ударение должно быть поставлено на слог с последней буквой И — миофибрИллы.
Помимо митохондрий и других клеточных органелл, в цитоплазме (саркоплазме) мышечного волокна присутствуют миофибри́ллы.
— Н. Б. Панкова, План-конспект ответов на вопросы экзамена по физиологии, 2009
Участок миофибри́ллы, расположенный между двумя телофрагмами, представляет собой саркомер — сократительную единицу.
— Г. Л. Билич, Атлас: анатомия и физиология человека. Полное практическое пособие, 2014
Органеллы могут быть общего значения и специальные (в клетках, выполняющих специфические функции: микроворсинки всасывающего эпителия кишечника, миофибри́ллы мышечных клеток и т.
— Е. А. Козлова, Общая биология: конспект лекций
Эти нейрофибриллярные нити рассматривались как независимые единицы, названные нейробионами; в этих структурах «адсорбируется возбудительная энергия», а миофибри́ллы участвуют в процессе нейропластичности и нейротрофичности в шванновских клетках.
— В. Д. Рыжков, Позитивная неврология, 2013
Функциональной единицей миофибри́ллы поперечнополосатой мышцы является саркомер.
— Коллектив авторов, Руководство по спортивной медицине, 2011