В данном слове ударение следует ставить на слог с последней буквой У — зарубцУется.
Я погибла бы тоже, если б не этот – мой теперешний… а потом глядим – мы уже и семья, хоть та рана и не зарубцу́ется даже.) Так вот – тут будет ответ на телеграмму т.
— Ольга Берггольц, Ленинградский дневник
А может случиться и наоборот, может быть, война и затянет эту червоточину, зарубцу́ется она, если в человеке больше все-таки человеческого.
— Анатолий Иванов, Вечный зов
Или, может, думала, что оно пройдет, покровоточит сердце да зарубцу́ется, пеплом покроется.
— Анатолий Иванов, Вечный зов
Это ведь постоянно так бывает: из дружного, слаженного кружка закадычных холостяков вдруг выбывает один перебежчик, чтобы навсегда погрузиться в лоно семейных тихих радостей, и весь кружок долго чувствует себя разрозненным, опустелым, пока не зарубцу́ется, не станет привычным изъян.
— Александр Куприн, Париж интимный