В упомянутом выше слове ударение следует ставить на слог с первой буквой И — загнИли.
Молодую рассаду предпочтительнее поливать под корень, чтобы вода не попадала на листочки и они не загни́ли.
— О. А. Ганичкина, Все о саде и огороде. Полная современная энциклопедия, 2014
Почву готовят так: смешивают поровну с песком, а сверху насыпают песок слоем 2 — 3 см с добавкой толчёного древесного угля, чтобы не загни́ли.
— Н. М. Звонарев, Декоративные кустарники. Особенности выращивания, стрижка, уход, 2010
Если корни цветка загни́ли или заплесневели, то их придётся аккуратно очистить от земли и срезать ножом, а затем продезинфицировать раствором марганцовки.
— Ксения Курбатова, Золотой ус и ароматерапия
Плоды патиссонов нужно изолировать от земли, чтобы их не повредили слизни и они не загни́ли.
— О. А. Ганичкина, 1000 ответов на самые важные вопросы о саде и огороде, 2013
Если вы не хотите чтобы корни загни́ли, не давайте воду раньше, т. к.
— Илья Мельников, Виды миниатюрных деревьев для вашего сада, 2012