В данном слове ударение должно быть поставлено на слог с буквой А — вырубАть.
Тополь идёт от корней, и его нельзя вырыть, а в земле надо выруба́ть корни.
— Л. Н. Толстой, Все лучшие сказки и рассказы, 2013
Сделать это в скальном сооружении было бы гораздо сложнее — скорее всего, пришлось бы выруба́ть из скалы ту же самую пирамиду.
— Этьен Кассе, В тисках мирового заговора, 2008
Освоение земель парка всё же неблагоприятно сказывалось на его целостности — всё больше и больше его деревьев продолжали выруба́ть под строительство.
— О. Г. Гончаренко, Москва, которую мы потеряли, 2008
Дальше действовал в режиме боевого мерцания, начав выруба́ть охрану с нижних уровней и до самого центрального выхода.
— Юрий Иванович, Оборванный след, 2014
Пришлось выруба́ть окрестные дубовые рощи, чтобы заменить обгоревшие брёвна кремля на свежее дерево.
— Сычев К. В., Дмитрий Красивый