В таком слове ударение следует ставить на слог с последней буквой А — взаимопроникАть.
Однако к середине 1990-х годов реальная и виртуальная жизнь стали взаимопроника́ть и взаимодействовать благодаря распространению персональных компьютеров и расширению интернет-инфраструктуры.
— Энтони Брэдли, Социальная организация: Как с помощью социальных медиа задействовать коллективный разум ваших клиентов и сотрудников, 2011
Идти навстречу друг другу – значит взаимопроника́ть структурами родственными.
— Зиновья Васильевна Душкова, Трактат о Любви Космической, 1999
Это значит, что вы неоднородны до такой степени, что не можете взаимопроника́ть друг в друга.
— Хранитель без титула, ВРС – Творец. Уроки Творения
Зародыш раскрыл эмбриональные органы чувств, органы пищеварения, железы и так далее и начал взаимопроника́ть с зарождающимся жизненным телом.
— Алексей Тихомиров, Заметки по тайноведению. Развитие. Книга вторая
Считается, что индивидуальная (личные воспоминания) и коллективная (ассоциирование себя с социальной группой) памяти могут взаимопроника́ть, но никогда не смешиваются.
— Коллектив авторов, Историческая память и диалог культур. Том 2, 2013