В указанном выше слове ударение падает на слог с последней буквой О — автотрОфы.
Например, главным отличием растений от грибов и животных является способ питания: растения — автотро́фы, а грибы и животные — гетеротрофы.
— Н. А. Лемеза, Альгология и микология. Практикум, 2008
Все живые организмы могут быть разделены на две группы: автотро́фы и гетеротрофы, которые отличаются источниками энергии и необходимых веществ для обеспечения своей жизнедеятельности.
— Евгений Краснодембский, Общая биология. Пособие для старшеклассников и поступающих в вузы, 2008
Другие автотро́фы используют энергию, освобождающуюся при химических реакциях окисления неорганических соединений.
— Андрей Казаков, Вящее в неприметном
Известны два основных типа питания микроорганизмов — автотро́фы и гетеротрофы.
— Андрей Казаков, Вящее в неприметном
Первый трофический уровень занимают автотро́фы, или так называемые первичные продуценты.
— Я. Л. Мархоцкий, Основы экологии и энергосбережения, 2014