В таком слове ударения ставят на слог с первой буквой А и на слог со второй буквой А — АвтотрАнспортной.
Восьмиэтажное здание а́втотра́нспортной компании «SRT» находилось в самом центре города.
— И. И. Гоменюк, История одного убийства, 2016
Принятие опасного груза к перевозке осуществляется а́втотра́нспортной организацией при предъявлении грузоотправителем паспорта безопасности вещества.
— Ю. А. Рубан, Автотранспорт в бухгалтерском учете (аренда, покупка, наем сотрудников). Практическое пособие, 2009
К заявлению прилагаются следующие документы: аварийная карточка системы информации об опасности; маршрут перевозки, разработанный а́втотра́нспортной организацией и согласованный с грузоотправителем; свидетельство о допуске транспортного средства к перевозке опасных грузов.
— Ю. А. Рубан, Автотранспорт в бухгалтерском учете (аренда, покупка, наем сотрудников). Практическое пособие, 2009
Разработка маршрута транспортировки опасных грузов осуществляется а́втотра́нспортной организацией, выполняющей эту перевозку.
— Ю. А. Рубан, Автотранспорт в бухгалтерском учете (аренда, покупка, наем сотрудников). Практическое пособие, 2009