В таком слове ударения ставят на слог с буквой А и на слог с последней буквой О — прогрАммно-целевОй.
В методологии стратегического планирования следует выделить его системность, характеризующуюся качественными элементами методологического подхода: комплексный, структурно-функциональный, програ́ммно-целево́й, мультипликативный, социально-нормативный, ресурсосберегающий и динамический.
— Г. А. Маховикова, Планирование на предприятии: конспект лекций, 2007
Кроме того, выделяют: програ́ммно-целево́й, многовариантных расчётов и экономико-математический.
— Мария Васильченко, Планирование на предприятии
Тем не менее програ́ммно-целево́й метод планирования используется на протяжении многих лет в большинстве развитых стран мира, в том числе и как эффективный инструмент бюджетного регулирования.
— В. Ю. Корчак, DARPA и наука Третьего рейха. Оборонные исследования США и Германии, 2014
Однако принципиальный подход обычно предполагает, что инстанции «руководства» более характерно общее направляющее воздействие, формулирование стратегических задач, програ́ммно-целево́й подход с созданием при необходимости базы либо в проектах уровня законов, либо в своих актах.
— Коллектив авторов, Современные проблемы организации публичной власти, 2014
В качестве основных специальных методов познания, разработанных для использования в процессе познания субъектов уголовного преследования, необходимо назвать такие методы, как програ́ммно-целево́й и комплексного подхода.
— О. Н. Коршунова, Преступления экстремистского характера, 2006