В таком слове ударение следует ставить на слог с последней буквой И — гипертрофИруется.
Заболевание обычно начинается с аменореи, далее следует атрофия молочных желез, гипертрофи́руется клитор, отсутствует либидо.
— Е. А. Ульрих, Опухоли яичника: клиника, диагностика и лечение, 2012
Синовиальная оболочка отекает и со временем гипертрофи́руется, то есть разрастается.
— Валерий Периостовцев, 2 в 1. Здоровые суставы. Побеждаем артроз, артрит, остеопороз + Здоровые сосуды. Побеждаем варикоз, тромбоз, атеросклероз, геморрой, 2016
Чтобы преодолеть все эти препятствия, сердцу приходится работать с большей нагрузкой, отчего сердечная мышца гипертрофи́руется.
— А. В. Кородецкий, Естественное очищение сосудов и крови по Малахову, 2010
Гипертрофи́руется и само понятие официального и неофициального, непризнанного искусства.
— М. А. Бессонова, Избранные труды (сборник)
Термин биосфера при таком подходе гипертрофи́руется настолько, что начинает конкурировать с термином универсум.
— В. П. Даниленко, От тьмы – к свету. Введение в эволюционное науковедение, 2015